Für die Stammzellsammlung wird der Spender an den Zellseparator angeschlossen. Hierfür ist es erforderlich, dass der Spender zwei stabile periphere Venenzugänge (Venenverweilnadeln) erhält.

Die Sammlung dauert durchschnittlich vier Stunden. Während dieser Zeit ist stets medizinisches Personal anwesend. Der Spender kann während der Sammlung lesen, fernsehen, essen und trinken.